Molecule

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3D 분자 데이터를 위한 Wandb 클래스입니다.

Molecule(
    data_or_path: Union[str, 'TextIO'],
    caption: Optional[str] = None,
    **kwargs
) -> None
ARG
data_or_path (string, io) Molecule은 파일 이름이나 io 오브젝트에서 초기화할 수 있습니다.
caption (string) 표시를 위해 분자와 연결된 캡션입니다.

Methods

from_rdkit

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@classmethod
from_rdkit(
    data_or_path: "RDKitDataType",
    caption: Optional[str] = None,
    convert_to_3d_and_optimize: bool = (True),
    mmff_optimize_molecule_max_iterations: int = 200
) -> "Molecule"

RDKit에서 지원하는 파일/오브젝트 유형을 wandb.Molecule로 변환합니다.

ARG
data_or_path (string, rdkit.Chem.rdchem.Mol) Molecule은 파일 이름이나 rdkit.Chem.rdchem.Mol 오브젝트에서 초기화할 수 있습니다.
caption (string) 표시를 위해 분자와 연결된 캡션입니다.
convert_to_3d_and_optimize (bool) 3D 좌표로 rdkit.Chem.rdchem.Mol로 변환합니다. 이는 복잡한 분자에 대해 시간이 오래 걸릴 수 있는 비용이 많이 드는 작업입니다.
mmff_optimize_molecule_max_iterations (int) rdkit.Chem.AllChem.MMFFOptimizeMolecule에서 사용할 반복 횟수입니다.

from_smiles

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@classmethod
from_smiles(
    data: str,
    caption: Optional[str] = None,
    sanitize: bool = (True),
    convert_to_3d_and_optimize: bool = (True),
    mmff_optimize_molecule_max_iterations: int = 200
) -> "Molecule"

SMILES 문자열을 wandb.Molecule로 변환합니다.

ARG
data (string) SMILES 문자열.
caption (string) 표시를 위해 분자와 연결된 캡션
sanitize (bool) 분자가 RDKit의 정의에 따라 화학적으로 합리적인지 확인합니다.
convert_to_3d_and_optimize (bool) 3D 좌표로 rdkit.Chem.rdchem.Mol로 변환합니다. 이는 복잡한 분자에 대해 시간이 오래 걸릴 수 있는 비용이 많이 드는 작업입니다.
mmff_optimize_molecule_max_iterations (int) rdkit.Chem.AllChem.MMFFOptimizeMolecule에서 사용할 반복 횟수입니다.
Class Variables
SUPPORTED_RDKIT_TYPES
SUPPORTED_TYPES

최종 수정 April 3, 2025